Las patatas fueron introducidas en Burundi alrededor de 1900 por los misioneros alemanes cuando los territorios eran una colonia alemana. En 1919, después de la Primera Guerra Mundial, los territorios fueron administrados por Bélgica hasta la independencia en 1962.
La adopción local del cultivo de la papa fue inicialmente lenta, y no fue hasta la década de 1930 que la papa se convirtió en un cultivo alimentario importante en zonas de producción adecuadas. El estímulo para el aumento de la producción provino en parte de las importaciones de nuevas variedades y de semillas limpias procedentes de Bélgica. En 1979, el Gobierno de Burundi, con ayuda de Bélgica, estableció un programa de mejora de la patata. El Programme d'Amélioration de la Pomme de Terre funciona bajo los auspicios del Institut des Sciences Agronomiques du Burundi (ISABU).
Las zonas más adecuadas para la producción de patata en Burundi son las tierras altas de la divisoria entre el Nilo y el Congo, a lo largo de las fronteras nororientales con Ruanda y la República Democrática del Congo.